ten główna różnica między CRISPR a Cas9 jest to CRISPR jest częścią bakteryjnego systemu obronnego, który składa się z krótkich sekwencji palindromicznych, podczas gdy Cas9 jest endonukleazą wytwarzaną przez system CRISPR, która działa jak nożyczki molekularne. CRISPR oznacza Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, podczas gdy Cas oznacza białko związane z CRISPR 9. Krótkie powtórzenia palindromiczne dają CRISPR RNA (crRNA), który jest specyficzny dla sekwencji docelowej. Cas9 tnie sekwencję DNA określoną przez crRNA.

CRISPR i Cas9 to dwa składniki systemu CRISPR/Cas9, ważnej części układu odpornościowego bakterii, który chroni przed atakującym wirusem. Obecnie system CRISPR/Cas9 jest jednym z szybszych, tańszych i dokładniejszych narzędzi do edycji genomu o szerokim zakresie zastosowań.

Kluczowe obszary objęte

1. Co to jest CRISPR – Definicja, struktura, edycja genomu 2. Co to jest Cas9? – Definicja, fakty, edycja genomu 3. Jakie są podobieństwa między CRISPR a Cas9 – Zarys wspólnych cech 4. Jaka jest różnica między CRISPR a Cas9? – Porównanie kluczowych różnic

Kluczowe terminy

Cas9, CRISPR, CRISPR/Cas9, crRNA, edycja genomu

Co to jest CRISPR

CRISPR (Clśniący rregularnie iz odstępami Short Palindromiczny rpowtórzeń) jest jednostką powtarzającej się sekwencji znalezionej w genomach bakterii i archeonów. Po raz pierwszy został odkryty w archeonach przez Francisco Mojica. Powtarzające się sekwencje CRISPR są przerwane przez sekwencje rozdzielające. Te sekwencje odstępnika są pozostałościami po dawnych najeźdźcach. Dlatego system służy jako pamięć genetyczna do wykrywania i niszczenia atakującego bakteriofaga. Sekwencje odstępnika są transkrybowane na krótkie sekwencje RNA zwane crRNA, które prowadzą system do wiązania się z określonymi sekwencjami docelowymi. Po związaniu się z taką sekwencją, endonukleaza kodowana przez system CRISPR, taka jak Cas9, przecina określony DNA, odcinając go.

Rysunek 1: System CRISPR

CRISPER/Cas9 to naturalnie występujący system edycji genomu bakterii. Jest również używany jako narzędzie do edycji genomu w laboratorium. Naukowcy sztucznie tworzą małe cząsteczki RNA zwane przewodnik RNA (gRNA), które wiążą się z docelową sekwencją genomu. Gdy docelowa sekwencja DNA zostanie odcięta przez aktywność Cas9, mechanizmy komórkowe ponownie syntetyzują DNA. Albo usunięta część DNA może zostać zastąpiona innym fragmentem DNA.

Co to jest Cas9?

Cas9 to endonukleaza, która tnie specyficzny dwuniciowy DNA. Jest kodowany przez bakteryjny system CRISPR. Docelowa sekwencja DNA jest określona przez sycrRNA systemu CRISPR. Manipulując sekwencją docelową, system CRISPR można wykorzystać do manipulowania konkretną sekwencją DNA w genomie. Dlatego system CRISPR/Cas9 jest stosowany w leczeniu zaburzeń genetycznych.

Rysunek 2: Rola CAS w systemie CRISPR

Innym rodzajem endonukleaz, które mogą współpracować z systemem CRISPR, jest Cpf1.

Podobieństwa między CRISPR a Cas9

Różnica między CRISPR a Cas9

Definicja

CRISPR odnosi się do rodziny sekwencji DNA występujących w bakteriach i archeonach, podczas gdy Cas9 odnosi się do endonukleazy DNA kierowanej przez RNA związanej z CRISPR

Oznacza

CRISPR oznacza skupione regularnie rozmieszczone krótkie powtórzenia palindromiczne, podczas gdy Cas oznacza białko związane z CRISPR.

Znaczenie

CRISPR to klaster krótkich sekwencji palindromicznych, podczas gdy Cas9 to endonukleaza kodowana w CRISPR.

Funkcjonować

CRISPR wytwarza crRNA, które specyficznie wiąże się z sekwencją docelową, podczas gdy Cas9 służy jako nożyce molekularne, które przecina sekwencję DNA określoną przez crRNA.

Wniosek

CRISPR to klaster krótkich sekwencji palindromicznych znalezionych w genomie bakterii. Jest to ważne w zapobieganiu inwazji bakteriofaga. Cas9 to endonukleaza kodowana przez system CRISPR. Odcina sekwencję nukleotydową określoną przez crRNA. crRNA jest wytwarzane przez transkrypcję macierzy CRISPR. Główną różnicą między CRISPR a Cas9 jest funkcja każdego komponentu w systemie CRISPR.

Referencja:

1. „Co to jest CRISPR-Cas9?” Fakty, Zespół ds. zaangażowania publicznego w kampusie Wellcome Genome, 19 grudnia 2016 r., Dostępny tutaj

Zdjęcie dzięki uprzejmości:

1. „crRNA-Cas9” Autor: marius Walter – Praca własna (CC BY-SA 4.0) przez Commons Wikimedia2. „Crispr” James atmos - Praca własna (CC BY-SA 3.0) przez Commons Wikimedia